Tarvitset stereomikroskoopin katsellaksesi suurempia näytteitä. Lisäksi sinun ei tarvitse valmistaa mikroskooppilasia stereomikroskooppia varten. Voit tarkkailla: papukaijan sulkaa, piirilevyä, tähtihiekkaa, kiteitä, koruja, lehtiä, mansikoita, mehiläisiä, laskuja, sormenjälkiä ja paljon muuta. 

Toisin kuin yhdistelmämikroskooppi, joka näkee vain hyvin ohuen näytteen, stereomikroskoopilla voidaan tarkastella melkein mitä tahansa, mikä mahtuu sen alle. Stereomikroskoopit tarjoavat kuitenkin pienemmän suurennuksen, tyypillisesti 2,5x-50x, verrattuna yhdistelmämikroskooppeihin. 

Stereomikroskoot ovat eriytyneet muista valomikroskoopeista "3D"-esineiden tarkastelua varten. Näihin kuuluvat suuremmat näytteet, kuten hyönteiset, höyhenet, lehdet, kivet, hiekanjyvät, jalokivet, kolikot ja postimerkit jne. Toiminnallisesti stereomikroskooppi on kuin tehokas suurennuslasi. Toisin kuin yhdistelmämikroskooppi, joka tarjoaa litteän kuvan, stereomikroskoot antavat katsojalle kolmiulotteisen kuvan, jossa voit nähdä suuremman näytteen tekstuurin.